肠簇细胞亚型代表由隐窝-绒毛信号梯度驱动的连续成熟阶段

肠簇细胞是上皮前哨细胞，在检测到寄生虫衍生的化合物后触发宿主防御。虽然它们代表了炎症驱动的肠道疾病免疫调节疗法的有效靶点，但人们对它们的功能和分化知之甚少。在这里，我们揭示了先前描述的小鼠和人类簇绒-1和簇绒-2亚型中常见的中间转录组。类器官中簇绒细胞亚型特异性报告基因敲入表明，这两种亚型反映了簇绒细胞谱系内连续的有丝分裂后成熟阶段。白细胞介素-4和13的体外刺激足以促进由簇绒前体（tuft-p）产生的新Nrep + 簇绒-1细胞的产生...

靶向SLC7A5治疗肺鳞状细胞癌：对癌症代谢转变和硼中子捕获治疗耐药性的影响

由于缺乏有效的治疗方法，鳞状细胞癌 （SCC） 构成了重大的全球健康挑战。硼中子俘获疗法（BNCT）是一种靶向粒子疗法，在各种癌症中显示出有希望的结果。SLC7A5 是 BNCT 中使用的必需氨基酸和硼苯丙氨酸 （BPA） 的转运蛋白，成为潜在的治疗靶点。然而，其在不同组织学亚型中的表达以及 SLC7A5 抑制在对 BPA-BNCT 耐药性中的作用仍然知之甚少。我们的研究表明，大多数 SCC 中的 SLC7A5 表达升高，特别是在肺鳞状...

祖细胞能力的时间控制决定了小鼠 GABA 能神经元发育的成熟

不同类型的 GABA 能投射神经元和端脑中间神经元来源于称为神经节隆起的腹侧生发区的祖细胞。使用单细胞转录组学、染色质可及性分析、谱系追踪、出生日期、跨发育阶段的移植和小鼠胚胎的扰动测序，我们研究了祖细胞能力如何影响这些神经元的成熟和分化。我们发现，神经发生的时间进程塑造了神经节隆起祖细胞的成熟能力，影响它们的后代如何走向成熟状态。相比之下，分化能力（定义为祖细胞产生不同转录组身份的能力）在整个神经发生过程中保持不变。染色质重塑与由转录...

质粒中 IL-12 和 CD40 配体 （CD154） 的瘤内表达产生消除肿瘤 T reg 的抗肿瘤反应

瘤内免疫疗法 （ITIT） 致力于通过直接刺激肿瘤中的免疫系统来逆转局部肿瘤介导的免疫抑制，从而产生有效的抗肿瘤免疫。使用体内质粒转染作为瘤内癌症免疫疗法的白细胞介素 12 （IL-12） 的体内表达进入转移性黑色素瘤的 II 期临床试验，但临床成功率有限。我们试图通过在编码 IL-12 的质粒治疗中加入表达 CD154 （CD40 配体） 的质粒来提高体内 IL-12 电穿孔的疗效，并评估对实体瘤的疗效。患有皮内 B16F10 黑色素...

基于质粒的电穿孔在永生化 T 淋巴细胞中进行高效基因工程

突出首次全面表征永生化 T 细胞系 CTLL-2 和 HT-2。质粒电穿孔可实现高效且具有成本效益的 T 细胞工程。用于 T 细胞电穿孔的优化转基因启动子和质粒结构。多功能转基因递送策略简化了 T 细胞工程工作流程。用于精确 T 细胞工程的高效 CRISPR/Cas9 基因组编辑工具包。摘要转基因 T 细胞疗法最近的临床成功凸显了加速 T 淋巴细胞基础研究和功能筛选方法的迫切需要。然而，一种简单且具有成本效益的 T 细胞高效基因工程方法...

植物中基于纳米材料的基因递送：即将到来的基因革命？

突出转基因允许将有益性状（如抗虫害和改善营养）引入作物，从而有助于满足全球粮食需求并提高农业复原力。农杆菌介导的转化和生物列表学等传统方法面临效率低、组织损伤和不可预测的基因整合等问题，这些问题限制了其有效性。纳米颗粒通过克服植物细胞壁障碍来提高基因递送效率和精度。将纳米技术与 CRISPR/Cas 和组织培养方法相结合，可以显著推进植物基因工程。纳米基因递送可以靶向细胞核、叶绿体和线粒体基因组，而不会造成明显的组织损伤，从而提高基因修...

使用噬菌体展示鉴定免疫原性共生抗原

体液免疫在建立和维持宿主-微生物群共生以及对病原微生物的免疫力中起着重要作用。然而，鉴定在屏障和全身组织内引发适应性免疫反应的抗原是进一步理解这种宿主-微生物对话的重大障碍。在这里，我们提供了一种方案，通过使用噬菌体（噬菌体）展示介导的抗体/抗原生物淘选来鉴定共生微生物和病原微生物表达的免疫原性蛋白抗原。该程序需要生成 M13 噬菌粒文库，生产 ORFeome（开放阅读框总量）噬菌体文库，然后进行多轮基于亲和力的免疫沉淀，随后通过 EL...

单纯疱疹病毒 1 型通过小鼠尿嘧啶-DNA 糖基化酶逃避 APOBEC1 介导的免疫

单纯疱疹病毒 1 （HSV-1） 是病毒性脑炎的最常见原因，尽管接受了抗病毒治疗，病毒性脑炎也可能是致命的或导致严重的神经功能缺损。载脂蛋白 B 信使 RNA 编辑酶，催化多肽样 （APOBEC） 蛋白基团可以作为病毒限制因子。HSV-1 如何逃避这种内在免疫机制尚不清楚。在这里，使用人癌 HEp-2 细胞，我们发现 HSV-1 尿嘧啶-DNA 糖基化酶的磷酸化和激活抵消了小鼠 APOBEC1 对 HSV-1 基因组的 DNA 编辑活性...

在疟原虫肝脏发育过程中，HaloPROTAC3 不会触发盐标记的寄生液泡膜蛋白 UIS4 的降解

靶向蛋白质降解 （TPD） 是开发针对病原体的治疗方法的一种新策略。在引起疟疾之前，疟原虫寄生虫在肝细胞内复制为肝脏阶段，周围环绕着寄生细胞液泡膜 （PVM）。我们假设 TPD 可用于触发宿主驱动的必需肝脏阶段 PVM 蛋白降解并导致寄生虫死亡。为了探索这一点，我们利用了蛋白水解靶向嵌合体 HaloPROTAC3，这是一种将宿主 von Hippel-Lindau （VHL） E3 连接酶募集到 HaloTag （HT） 的分子。在伯氏...

用于精确克隆分离的多界遗传条形码系统

使用 DNA 条形码的细胞标记策略能够分析异质性群体中的克隆大小动态和克隆限制性转录组景观。然而，从复杂群体中分离显示特定表型的目标克隆仍然具有挑战性。在这里，我们提出了一种多王国遗传条形码系统 CloneSelect，它能够触发靶细胞克隆表达报告基因，通过条形码特异性 CRISPR 碱基编辑进行分离。在 CloneSelect 中，首先用 DNA 条形码稳定标记细胞并增殖，以便其亚群可以进行给定的实验。然后，可以使用 CRISPR 碱...

恶性疟原虫的快速进化 FIKK 激酶家族可被单一化合物抑制

在 250 种疟原虫中，有 6 种感染人类，恶性疟原虫导致每年 600,000 例与疟疾相关的死亡中的 95% 以上。其病理学源于 400 多种输出的寄生虫蛋白（包括 FIKK 激酶家族）驱动的宿主细胞重塑。大约 100 万年前，一种感染鸟类的疟原虫物种杂交成类人猿，一种未输出的 FIKK 激酶获得了一种输出元素。这导致其迅速扩增成 15-21 种非典型输出的 Ser/Thr 效应激酶。在这里，使用基因组和蛋白质组学分析，我们通过亚细胞...

DAAM1 中高度保守的神经元微外显子控制肌动蛋白动力学、RHOA/ROCK 信号传导和记忆形成

肌动蛋白细胞骨架动力学对于神经系统的正常发育和功能至关重要。一组保守的神经元特异性微外显子影响神经生物学的多个方面;然而，它们在调节肌动蛋白细胞骨架中的作用尚不清楚。在这里，我们研究了 DAAM1 中的微外显子，DAAM1 是一种参与肌动蛋白重组的 formin-homology-2 （FH2） 结构域蛋白。微外显子包涵扩展了 DAAM1 FH2 结构域的接头区域，改变了肌动蛋白聚合。微外显子的基因组缺失导致神经发生缺陷和分化神经元中钙...