拥挤的细胞内环境会影响RNA结构和相互作用。虽然细胞内核磁共振 (NMR) 波谱可以对活体人体细胞中的 RNA 进行原子分辨率研究,但由于 RNA 快速降解,其应用受到限制。在这项研究中,我们将 RNase 抑制剂混合物引入活体人体细胞中,并获得了与 HIV-1 Tat 强结合的 RNA 适体的细胞内 NMR 光谱,无论是否含有源自 Tat 的肽。引入RNase抑制剂混合物有效抑制了RNA降解。显着延长的寿命使得在生理温度下能够观察活体人体细胞中游离适配体及其与肽复合物的完整细胞内核磁共振光谱。游离和复合形式的细胞内核磁共振谱为了解活细胞中RNA提供了结构见解,以了解紧密结合的机制,包括仅在复合物中形成U-A-U碱基三联体。这是在不对适配体进行化学修饰的情况下实现的。RNase 抑制剂混合物易于应用且具有成本效益,因此该技术适用于 RNA 的各种细胞内 NMR 分析。这项创新为解开细胞过程和设计以 RNA 为中心的新型药物提供了途径。
原标题:In-cell NMR spectra of chemically unmodified RNA at physiological temperature with extended lifetime through RNase inhibitor cocktail in living human cells
通讯作者:Takashi Nagata & Masato Katahira
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