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靶向 DNA ADP 核糖基化触发细菌模板化修复和真核生物碱基诱变

碱基编辑器通过引导核碱基脱氨或去除来创建精确的基因组编辑,而不会诱导双链 DNA 断裂。然而,基因组编辑的其他 DNA 修饰的巨大化学空间仍有待探索。在这里,我们利用细菌抗噬菌体毒素 DarT2 将 ADP-核糖基部分附加到 DNA 上,从而在细菌与真核生物中解锁不同的编辑结果。我们将减毒的 DarT2 融合到 Cas9 切口酶,对靶 DNA 序列内胸腺嘧啶的位点特异性 ADP 核糖基化进行编程。在测试的细菌中,靶向驱动同源重组,提供灵活且无疤痕的基因组编辑,无需碱基替换或反选择。在测试的酵母、植物和人类细胞中,靶向驱动修饰的胸腺嘧啶取代为腺嘌呤或腺嘌呤和胞嘧啶的混合物,插入或缺失有限,从而提供当前碱基编辑器无法访问的编辑。总而言之,我们的方法称为附加编辑,利用在 DNA 中添加化学部分来扩展当前的精确基因编辑模式。

原标题:Targeted DNA ADP-ribosylation triggers templated repair in bacteria and base mutagenesis in eukaryotes

通讯作者:Jose M. Alonso & Chase L. Beisel

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