用于精确克隆分离的多界遗传条形码系统

使用 DNA 条形码的细胞标记策略能够分析异质性群体中的克隆大小动态和克隆限制性转录组景观。然而，从复杂群体中分离显示特定表型的目标克隆仍然具有挑战性。在这里，我们提出了一种多王国遗传条形码系统 CloneSelect，它能够触发靶细胞克隆表达报告基因，通过条形码特异性 CRISPR 碱基编辑进行分离。在 CloneSelect 中，首先用 DNA 条形码稳定标记细胞并增殖，以便其亚群可以进行给定的实验。然后，可以使用 CRISPR 碱基编辑从实验期间存储的初始或后续细胞库中分离在给定时间显示目标表型或基因型的克隆。CloneSelect 具有可扩展性，并与单细胞 RNA 测序兼容。我们证明了 CloneSelect 在人胚胎肾 293T 细胞、小鼠胚胎干细胞、人多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞中的多功能性。

原标题：A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation
源于Nature Biotechnology (2025) 通讯作者：Yasuhiro Takashima & Nozomu Yachie

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